Do geofyzikálních databází byly zpracovávány výsledky z geofyzikálních průzkumů, prováděných převážně Geofyzikou n.p. z prostředků státního rozpočtu. Geochemická databáze byla vytvořena v rámci úkolu "Jednotné geochemické databáze", který řešilo v letech 1996 - 2004 Geomin družstvo, Jihlava na základě smlouvy s Ministerstvem hospodářství ČR, od roku 1997 s Ministerstvem životního prostředí ČR. Data geofyziky se doplňují o nová aktuální měření.
Naplňování geofyzikálních databází probíhalo v národním podniku Geofyzika od roku 1972 a bylo hrazeno z prostředků státního rozpočtu. Po zrušení činnosti Geofyziky, a.s. Brno, byla od 1.9.2003 část geofyzikální skupiny přičleněna ke Geofondu jako samostatné oddělení geofyzikálních dat a všechny geofyzikální databáze, včetně databáze geofyzikální prozkoumanosti, byly integrovány do informačního systému ČGS - Geofondu, nyní do IS České geologické služby.